Genome Report of Planktothrix agardhii No.365

Planktothrix agardhii No.365

[index] - [schematics] - [save as Word doc]

Putative Planktothrix agardhii No.365 RM systems

Sequence name: chromosome I

GenBank: LR882944 (4,711,865 bp)

Type	Gene	Name	Predicted Rec Seq	Coordinates

I	M	M.Pag365ORF734P		836296-837807
I	S	S.Pag365ORF734P		839891-841018
I	R	Pag365ORF734P		842194-845671

I	R	Pag365ORF2409P		2685557-2688091
I	M	M.Pag365ORF2409P		2688848-2691352

I	S	S.Pag365ORF2552P		2848080-2848367
I	M	M.Pag365ORF2552AP		2849135-2849389
I	M	M.Pag365ORF2552BP		2849436-2850245

II	RM	Pag365ORF51P		65591-68914

II	M	M.Pag365ORF68P		88634-89659

II	M	M.Pag365ORF103P		134024-135997

II	M	M.Pag365ORF119P		151395-152252
II	R	Pag365ORF119P		152284-153033 c

II	R	Pag365ORF424BP		464240-464497 c
II	R	Pag365ORF424AP		464674-464832 c
II	M	M.Pag365ORF424P		465285-467573

II	M	M.Pag365ORF564P	CCTNAGG	644147-645394

II	M	M.Pag365ORF606P	CAGCTG	693946-695748 c

II	M	M.Pag365ORF763P		866568-869735
II	R	Pag365ORF763P		870477-873875

II	M	M.Pag365ORF827P		947669-949846 c

II	M	M.Pag365ORF1015P	AGATCT	1209896-1210996

II	RM	Pag365ORF1105P		1336074-1339679

II	RM	Pag365ORF1328P		1555645-1558731

II	RM	Pag365ORF1404P		1638518-1641214 c

II	M	M.Pag365ORF1447P		1691043-1691927 c

II	M	M.Pag365ORF1475P		1715811-1716677 c

II	M	M.Pag365ORF1499P		1734940-1736196
II	R	Pag365ORF1499P		1736210-1736866

II	M	M.Pag365ORF1536P	GTCGAC	1775577-1776617
II	R	Pag365ORF1536P	GTCGAC	1777309-1778409 c

II	RM	Pag365ORF1813P		2047470-2051249

II	R	Pag365ORF1822P	GCTAGC	2057062-2057790
II	M	M.Pag365ORF1822P		2057783-2058436

II	RM	Pag365ORF1924P		2170347-2173100 c

II	M	M.Pag365ORF2004P		2258302-2259414
II	R	Pag365ORF2004P		2259426-2260409

II	M	M.Pag365ORF2077P		2321984-2323138

II	RM	Pag365ORF2087P		2334964-2337975 c

II	M	M.Pag365ORF2133P		2392602-2393735 c

II	M	M.Pag365ORF2178P		2439315-2440508 c
II	R	Pag365ORF2178P	TCTAGA	2440533-2441180 c

II	M	M.Pag365ORF2238P		2496582-2497322

II	M	M.Pag365ORF2444P	ATCGAT	2725280-2727031
II	R	Pag365ORF2444P	ATCGAT	2727005-2728279 c

II	M	M.Pag365ORF2452P		2742775-2744292

II	M	M.Pag365ORF2455P		2745731-2746690

II	RM	Pag365ORF2650P		2946549-2949302

II	M	M.Pag365ORF2695P		2993650-2994948 c

II	M	M.Pag365ORF2758P	GRCGYC	3068636-3069550 c
II	R	Pag365ORF2758P	GRCGYC	3069547-3070614 c

II	RM	Pag365ORF2947P		3276494-3279661 c

II	R	Pag365ORF2956P		3288687-3289841 c
II	M	M.Pag365ORF2956P	ATGCAT	3289822-3290709 c

II	R	Pag365ORF2994P		3326908-3327285 c
II	M	M.Pag365ORF2994P		3327282-3328715 c

II	M	M.Pag365ORF3205P	ATTTAAAT	3543865-3545595
II	R	Pag365ORF3205P	ATTTAAAT	3545564-3546277 c

II	R	Pag365ORF3219P	TCCGGA	3556899-3557867 c
II	M	M.Pag365ORF3219P	TCCGGA	3557864-3558826 c

II	RM	Pag365ORF3291P		3634129-3637629 c

II	M	M.Pag365ORF3548P		3886406-3887341

II	M	M.Pag365ORF3553P		3892338-3892850

II	RM	Pag365ORF3560P		3898019-3900883 c

II	M	M.Pag365ORF3659P		4003328-4004614 c

II	R	Pag365ORF3851P		4224907-4225875

II	M	M.Pag365DndCP		4225883-4227463

II	M	M.Pag365DndDP		4227611-4229596

II	M	M.Pag365DndEP		4229995-4230396

II	R	Pag365ORF4141P		4551857-4552381 c
II	M	M.Pag365ORF4141P		4552378-4553127 c

II	M	M.Pag365ORF4179P		4594240-4595733

III	M	M.Pag365ORF1990P		2240422-2243406

III	R	Pag365ORF3335P		3678852-3679163 c
III	M	M.Pag365ORF3335P		3679160-3680800 c

IV	R	Pag365McrCP		1842633-1843835 c
IV	R	Pag365McrBP		1843977-1846286 c

IV	R	Pag365MrrP		4418296-4419201 c

Sequence name: plasmid p4

GenBank: LR882948 (135,980 bp)

Type	Gene	Name	Coordinates

I	R	Pag365ORF4467P	70562-73714 c
I	S	S.Pag365ORF4467P	73770-75053 c
I	M	M.Pag365ORF4467P	75050-76660 c

II	RM	Pag365ORF4419P	20797-24837

II	RM	Pag365ORF4474P	84468-87926

Sequence name: plasmid p1

GenBank: LR882945 (64,491 bp)

Type	Gene	Name	Coordinates

I	R	Pag365ORF4297P	4684-7476 c
I	S	S.Pag365ORF4297P	8175-9467 c
I	M	M.Pag365ORF4297P	10914-12527 c

IV	R	Pag365GmrSDP	32350-34440 c

Sequence name: plasmid p2

GenBank: LR882946 (39,671 bp)

Type	Gene	Name	Predicted Rec Seq	Contig	Coordinates

II	RM	Pag365ORF4368P			19625-23242 c

Tech Support Feedback NEB Overview Site Map Trademarks Legal and Disclaimers Privacy Cookie Policy Terms of Use