REBASE Home

Compost metagenome

[index] - [schematics] - [save as Word doc]
 REBASE Genomes

Putative Compost metagenome RM systems

GenBank: RCUI00000000

 

Type Gene Name Predicted
Rec Seq		 Contig Coordinates
 
I M M.CmeDORFMP 1-1749 c
 
I R CmeDORF173510P 1-1992 c
I S S.CmeDORF173510P 2074-3462 c
I M M.CmeDORF173510P 3452-5068 c
 
I R CmeDORFOP 2-2785 c
 
I R CmeDORF334400P 2-292 c
I S S.CmeDORF334400P 292-1665 c
I M M.CmeDORF334400P 1658-2134 c
 
I M M.CmeDORFAP 2-1357 c
I S S.CmeDORFAP 1408-1998 c
 
I S S.CmeDORF272220P 2785-3252 c
 
I S S.CmeDORF254160P 3-467 c
I M M.CmeDORF254160P 470-2089 c
 
I M M.CmeDORF160950P 12-755
I S S.CmeDORF160950P 752-2203
I R CmeDORF160950P 2203-5412
 
I R CmeDORF169970P 19-3081
 
I M M.CmeDORF297480P 61-603
I S S.CmeDORF297480P 600-1787
 
I R CmeDORF259400P 61-522
I M M.CmeDORF259400P 698-2236
I S S.CmeDORF259400P 2233-3624
 
I M M1.CmeDORF259330P 66-1409
I M M2.CmeDORF259330P 1578-3125
I S S.CmeDORF259330P 3122-3625
 
I R CmeDORFNP 682-3969
 
I M M.CmeDORF210680P 1382-3889
I S S.CmeDORF210680P 4014-5204
I R CmeDORF210680P 5204-5494
 
I M M.CmeDORF282470P 227-2062
I S S.CmeDORF282470P 2059-3033
 
I R CmeDORF238420P 243-3527
 
I M M.CmeDORF272620P 314-1924
I S S.CmeDORF272620P 1921-3258
 
I S S1.CmeDORF220650P 838-1410
I M M.CmeDORF220650P 1414-2937
I S S2.CmeDORF220650P 2927-4153
I R CmeDORF220650P 4698-5024
 
I M M.CmeDORF107310P 530-2161 c
I S S.CmeDORF107310P 3584-4879 c
I R CmeDORF107310P 4883-7903 c
 
I M M.CmeDORF89510P 3741-5699
I S S.CmeDORF89510P 6953-8287
I R CmeDORF89510P 10649-13825
 
I R CmeDORF245140P 1878-4067 c
 
I R CmeDORFLP 827-3292
I M M.CmeDORFLP 3412-4620
 
I M M.CmeDORFPP 838-3267
 
I R CmeDORF189630P 1583-4735 c
I S S.CmeDORF189630P 4748-5941 c
I M M.CmeDORF189630P 5938-6708 c
 
I M M.CmeDORF46430P 4111-6573
I S S.CmeDORF46430P 6573-7901
 
I M M.CmeDORF110500P 4922-6724
I S S.CmeDORF110500P 6714-8081
I R CmeDORF110500P 10367-13516
 
I R CmeDORF116060P 6134-9427 c
I S S.CmeDORF116060P 9620-10858 c
I M M.CmeDORF116060P 10855-13056 c
 
I R CmeDORF79180P 9304-11676
I M M.CmeDORF79180P 12516-14000
I S S.CmeDORF79180P 13997-15694
 
I R CmeDORF46480P 17484-20588
 
I S S.CmeDORF45490P 26211-28547 c
I M M.CmeDORF45490P 28544-30013 c
I R CmeDORF45490P 30102-32468 c
 
II M M.CmeDORFSP 1-816
 
II M M.CmeDORFRP 1-1137
 
II M M.CmeDORFFP 1-1008 c
 
II M M.CmeDORF249230P GCCGGC 419-1582
II R CmeDORF249230P GCCGGC 1608-2558
 
II M M.CmeDORF396530P 24-1130
II R CmeDORF396530P 1063-1482
 
II M M.CmeDORF326770P 30-1244 c
 
II M M.CmeDORF396610P 36-1382 c
 
II M M.CmeDORF292360P 46-717
 
II M M.CmeDORF282070P 53-2721 c
 
II RM CmeDORF166190P 69-3314
 
II M M.CmeDORF374160P 87-860 c
 
II M M.CmeDORF394260P 811-1482 c
 
II M M.CmeDORF414360P 108-1031
 
II M M.CmeDORF247080P 109-1419
 
II M M.CmeDORF354110P 527-1450 c
 
II R CmeDORF291820P 129-941 c
II M M.CmeDORF291820P 934-2220 c
II V V.CmeDORF291820P 2198-2608 c
 
II V V.CmeDORF219910P 142-549 c
II M M.CmeDORF219910P 1915-3063
 
II M M.CmeDORF459470P 172-990 c
 
II V V.CmeDORF197910P 189-626 c
II M M.CmeDORF197910P 695-2284
 
II M M.CmeDORF280170P 1269-2393 c
 
II M M.CmeDORF402680P 640-1218
 
II M M.CmeDORFQP 240-1357
 
II M M.CmeDORF269580P 748-1671
 
II M M.CmeDORF255500P 290-2026
 
II M M.CmeDORF176780P 290-1246
II R CmeDORF176780P 1246-2109
 
II M M.CmeDORF394400P 300-1463
 
II M M.CmeDORF364990P 430-1761
 
II M M.CmeDORF253690P 1525-2568 c
 
II M M1.CmeDORF226380P 941-2812
II M M2.CmeDORF226380P 2809-4803
 
II M M.CmeDORF251410P 1136-2059 c
 
II M M.CmeDORF145720P 1248-2291
II V V.CmeDORF145720P 2310-2783
 
II M M.CmeDORF210460P 1443-3335 c
 
II M M.CmeDORF212760P 1465-2271 c
 
II R CmeDORF54600P 3209-4426
II M M.CmeDORF54600P 4521-5957 c
II V V.CmeDORF54600P 6248-6679
 
II M M.CmeDORF168780P 2469-3656
 
II V V.CmeDORF112540P 2483-2905 c
II M M.CmeDORF112540P 2934-4586
 
II M M.CmeDORF222910P 2574-3707
 
II M M.CmeDORF207110P 2479-5511
 
II M M.CmeDORF244860P 2818-3741
 
II M M.CmeDORF275650P 2259-3182
 
II M M.CmeDORF242300P 2486-3207
 
II M M.CmeDORF194710P 2759-3553
 
II M M.CmeDORF117810P 4802-6025 c
II V V.CmeDORF117810P 6137-6631
 
II RM CmeDORF145750P 5926-10011
 
II M M.CmeDORF174740P 3632-6538
 
II M M.CmeDORF147370P 3810-5405
 
II M M.CmeDORFBP 5505-6281
 
II M M.CmeDORF41930P 5932-7608 c
 
II M M.CmeDORF132090P 6612-7481 c
 
II M M.CmeDDamP GATC 9245-10117 c
 
II M M.CmeDORF29110P 11180-12235
 
II M M.CmeDORF4320P 18017-18943 c
 
II M M1.CmeDORF4330P 19140-20570 c
II M M2.CmeDORF4330P 20740-22254 c
 
II M M.CmeDORF4500P 28804-29424 c
 
II M M.CmeDORF29420P 35941-37605 c
 
II M M.CmeDORF17310P 46592-48496
 
II M M.CmeDORF17320P 48493-50304
 
II M M.CmeDORF20740P 52717-53569 c
 
III M M.CmeDORF208860P 58-2736
 
IV R CmeDMcrC4P 1-1107 c
IV R CmeDMcrB4P 1151-2644 c
 
IV R CmeDMcrC3P 453-1724 c
IV R CmeDMcrB3P 1721-4297 c
 
IV R CmeDMcrC5P 1585-2928 c
IV R CmeDMcrB5P 2939-3235 c
 
IV R CmeDORF192220P 1607-4750
 
IV R CmeDMcrBP 2286-4304
IV R CmeDMcrCP 4301-5638
 
IV R CmeDMrrP 5422-6333
 
IV R CmeDMrr2P 3922-4854
 
IV R CmeDMcrB2P 3805-6186
IV R CmeDMcrC2P 6190-7557
 
IV R CmeDMrr4P 5083-5763 c
 
IV R CmeDORF93070P 4597-5544
 
IV R CmeDMrr3P 11655-12575
 
Orphan
M		 M M.CmeDORF291300P 199-1278

 

Tech Support Feedback NEB Overview Site Map Trademarks Legal and Disclaimers Privacy Cookie Policy Terms of Use
© Copyright 2023 New England Biolabs. All Rights Reserved.